O complexo do Templo de Philae esteve no seu local original durante dois milénios antes da construção da Barragem Baixa de Assuão, em 1902, ter submergido as suas fundações durante metade de cada ano. Quando a UNESCO interveio na década de 1960, as águas crescentes do Lago Nasser ameaçavam apagá-lo completamente. A relocalização para a Ilha Agilkia preservou não apenas a arquitetura, mas também a lógica espacial do local — pátios colunados, salas hipóstilas e um santuário outrora vedado a todos, exceto ao sacerdócio de Ísis.
Philae foi o último templo funcional da religião antiga. Inscrições hieroglíficas registam oferendas feitas aqui até ao século VI, muito depois de o resto do Egito se ter convertido. A ilha em si era considerada terra sagrada, proibida aos peregrinos comuns, que apenas podiam aproximar-se de barco e observar os rituais à distância. O templo principal, dedicado a Ísis, domina o complexo com uma fachada de pilone esculpida em relevo profundo — Ptolomeu XII a abater inimigos, barcas celestiais, discos solares alados. Atrás dos pátios exteriores encontra-se o mammisi, ou casa do nascimento, onde ritos anuais celebravam o nascimento divino de Hórus. Adições romanas são visíveis no quiosque colunado de Trajano, um pavilhão sem teto que servia outrora como a entrada cerimonial do Nilo.
As esculturas retêm grande parte dos seus detalhes originais, apesar dos séculos debaixo de água. Grafites franceses riscados pelos soldados de Napoleão em 1799 partilham espaço na parede com escrita demótica e inscrições meroíticas deixadas por peregrinos núbios. A cruz copta cinzelada sobre relevos faraónicos marca o período em que o templo foi reaproveitado como igreja. Hieróglifos nas paredes do santuário interior descrevem o mito de Osíris e o ciclo anual de cheias, ligando o calendário litúrgico do templo aos ritmos do rio.
Hoje, cada passeio ao Templo de Philae começa com um transporte de barco a motor a partir da marina de Assuão. A ilha não tem habitação permanente e fecha ao pôr do sol, exceto durante o programa noturno de som e luz. O projeto de resgate da UNESCO transformou Agilkia numa quase réplica dos contornos da ilha original, escalonando a rocha para corresponder à orientação do templo para o Nilo. O complexo recebe menos visitantes do que Abu Simbel, mas continua a ser um dos exemplos mais completos de arquitetura religiosa ptolemaica ainda existentes.
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